隨著科學技術的進步，巴氏殺菌法被廣泛以用，而且現在出現了各式各樣的巴氏殺菌法。

比如高低溫處理法、生物處理法等“低溫長時間：處理是一個間歇的過程，如今至被小型乳品廠用來生產一線奶酪制品。

“高溫短時間"處理是一個流動的過程，通過在板式換熱器中進行交換，如今至被廣泛用于飲用牛奶的生產，

通過該方式獲得產品不是無菌的，即含有微生物，而且在貯存上都需要冷藏。“快速巴氏殺菌機"主要應用于酸奶乳制品。

近年國家通用的巴氏高溫消毒法分為兩種：一種是將牛奶熱到62-65℃，保持30分鐘；而另一種則是利用巴氏殺菌法將牛奶在乳化罐設備中加熱到75-90℃，保溫15秒，需要指出的是，喝鮮奶反而不是安全的，因為他可能含有對身體有害的細菌，

另一點，巴氏消毒法也不是的因為經過巴氏消毒法處理后的牛奶仍然要貯存在較低溫度下一般為＜4℃，否則還有有變質的可能性。